Historia de la Bioinformática

  • Descubrimiento de la estructura bioquímica del ADN

    Los científicos de la Universidad de Cambridge D. Watson and Francis H.C. Crick habían anunciado el descubrimiento de la estructura de doble Hélice de las moléculas que contienen los genes.
  • Secuenciación de la primera proteína

    Margaret O. Dayhoff describió la secuencia de la insulina
    bovina, un pequeño péptido de 51 aminoácidos.
  • Secuención del primér ácido nucléico

    Secuenciación de un ARNt que asociado a la codificación de un codón de alanina en Saccharomyces cerevisiae. ( Levadura)
  • Aparece la primera base de datos de secuencias Biológicas

    En 1965,
    Margaret Dayhoff creó la primera base de datos de
    secuencias biológicas la cual tenía a disposición de la comunidad científica todas las secuencias de ADN y proteínas descritas hasta la
    fecha.
  • Aparición de la Base de Datos Protein Data Bank (PDB)

    Es la base de datos más antigua actualmente vigente. Su propósito era almacenar la estructuras tridimensionales de las proteínas obtenidas con cristalografía de rayos X.
  • Aparición de PAM ( Point Accepted Mutation)

    Margaret Dayhoff fue la encargada de generar la primera matriz de substitución de aminoácidos. Esta base de datos permitió interpretar patrones de secuencias para estudios de evolución y filogenia molecular.
  • Creación de la base de datos GenBank. ( NCBI)

    El Theoretical Biology and Byophysics Group adscrito al instituto
    norteamericano The Alamos Nacional Laboratory, junto con Standford University, dieron origen a la base de datos más conocida en el mundo.
  • Creación del algoritmo BLAST

    Temple Smith y Michael Waterman revisaron extensamente los algoritmos matemáticos propuestos por Needleman y Wunsch
    en 1970 para la comparación de secuencias biológicas.
  • Creación de la base de datos EMBL ( (European Molecular Biology Laboratory)

    Es la variante Europea de Genebank.
  • Creación de la base de datos DDBJ (DNA Data Bank of Japan)

    Es una variante asiática del Genbank
  • Reporte del Algoritmo FASTA

    Se reportó el algoritmo FASTA (FAST-All) de comparación de secuencias, el cual directamente operaba como motor de búsqueda de secuencias similares dentro de la base de datos GenBank
  • Implementación del algoritmo BLAST

    La implementación del algoritmo BLAST (Basic Local Alignment Tool) revolucionó completamente la exploración y búsqueda de secuencias biológicas en bases de datos.
  • Inicio de la era genómica

    El consorcio Human Genome, HUGO es quien inicia el ambicioso proyecto de secuenciación del genoma humano.
  • Secuenciación del genoma de Haemophilus influenzae

    Haemophilus influenzae es el virus causante de la Influenza
  • Secuención del genoma de Escherichia coli

    Bacteria causante del Cólera y microorganismo vector utilizado en la tecnología del ADN recombinante
  • Secuenciación de los genomas de Caenorhabditis elegans y Pseudomonas aeruginosa

  • Secuenciación de los genomas de Drosophila melanogaster y Arabidopsis thaliana.

  • Finalización del proyecto de Secuenciación del genoma Humano.

  • Secuenciación de genomas de eucariotas superiores

    Se publica la primera comparación y análisis de varios genomas completos de eucariotas superiores. (12 especies de Drosophila)
  • Creación del consorcio GeBIX

    Creación de un Centro de Excelencia en Metagenómica y
    Bioinformática al consorcio GeBIX en Colombia
  • El super computador Mare Nostrum

    Comparación de genomas completos realizadas en supercomputadores con 6000 procesadores en paralelo del Centro Nacional de supercomputación de España.
  • Inicio de la era de investigación en modelos metabólicos a escala genómica.

    Reconstrucción in silico del modelo metabólico de Arabidopsis thaliana a través de la integración de bases de datos
  • Desarrollo de herramientas de analisis de RNA seq

    Análisis de transcriptomas provenientes de tecnologías de secuenciación profunda
  • Period: to

    El boom de las tecnologías de secuenciación de alto rendimiento o de nueva generación "NGS"

    Secuenciación de alto rendimiento de genomas de grandes mamíferos, reptiles y aves con tecnologías ROCHE, Ilumina, Roche, sOLID ( Revisar kblom R, Wolf JB. A field guide to whole-genome sequencing, assembly and annotation. Evol Appl. 2014
  • Edición de genomas a través de la tecnología CRISPR/Cas

    Los grupos de investigación de Emanuelle Charpentier y Jennifer Doudna publicaron un artículo donde postularon el uso de CRISPR Cas para la edición génica
  • Modelo computarizado de la interacción compatible entre Phytophthora infestans y Solanum tuberosum. (papa)

    Modelo computarizado con 70% de predicción de las fases de desarrollo del tizon tardío en papa desarrollado por investigadores de la Universidad Nacional de Colombia