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Arco de la Prueba de Graduación de la Academia:
El primer arco de Naruto presenta la vida de Naruto, un marginado debido al Kyūbi, con pruebas que incluyen el robo de un pergamino y una rivalidad con Sasuke. Mizuki manipula a Naruto para robar el pergamino prohibido, pero Iruka pone a prueba su lealtad. Naruto usa el "jutsu multiclones de sombras" para vencer a Mizuki. El arco termina con Naruto e Iruka trabajando juntos, marcando su relación como primer sensei y la primera confianza en el marginado. -
Arco del País de las Olas
En una misión en el País de las Olas, el Equipo 7 se enfrenta a ninjas de la Aldea de la Niebla, liderados por Zabuza y Haku. La misión inicialmente sencilla se vuelve peligrosa. Bajo la guía de Kakashi, el equipo crece y se fortalece, y la relación entre Naruto y Sasuke se destaca. El arco termina con la derrota de Zabuza y Haku y el regreso a Konoha. -
Arco del Examen de Chūnin
En el Examen de Chūnin de Konoha, los ninjas compiten en pruebas escritas y desafíos en el Bosque de la Muerte. Sasuke crece, Naruto se enfrenta a Orochimaru y hay combates icónicos en los preliminares. Orochimaru interviene, Rock Lee se lesiona en su combate y la final enfrenta a Naruto y Gaara, ambos portadores de Bestias con Colas. El arco concluye con Naruto venciendo a Gaara y Sasuke recuperándose. -
Arco del Rescate de Sasuke
Sasuke busca venganza contra su hermano, Itachi, y abandona la aldea. Naruto, Sakura y Kakashi lo persiguen, enfrentando a enemigos como los Ninjas del Sonido. Naruto enfrenta a los 4 del Sonido y mejora sus habilidades. Encuentra a Sasuke, pero este ha cambiado bajo la influencia de Orochimaru. La batalla simbólica termina con Sasuke derrotando a Naruto y desertando en busca de venganza. -
Arco de la Búsqueda de Gaara
Naruto y Sakura se unen a una misión para rescatar a Gaara, el Kasekage de la Aldea de la Arena, secuestrado por los Akatsuki. En su búsqueda, enfrentan a miembros de los Akatsuki como Deidara y Sasori. Naruto y su equipo rescatan a Gaara, evitando la extracción de su Bestia con Cola. Gaara muere pero es resucitado gracias al sacrificio de Chiyo. El arco concluye con Gaara a salvo y de regreso como Kasekage, pero sin su Bestia con Cola, y Naruto regresa a Konoha. -
Arco de la Invasión de Pain
Pain, líder de Akatsuki, destruye Konoha en busca del Rinnegan. La aldea enfrenta caos y lucha contra los cuerpos de Pain. Naruto regresa tras entrenar con Jiraiya y desata su furia para salvar Konoha. La batalla contra Pain en su forma Sage es épica. Jiraiya muere investigando a Pain y su vínculo con Naruto. Naruto convence a Pain de detener el ataque, convirtiéndose en héroe y terminando la invasión de Konoha. -
Arco de la Reunión de los Cinco Kages
Sasuke interrumpe una reunión de los líderes de aldeas en busca de venganza como miembro de Akatsuki, pero Tobi revela su identidad y amenaza a los Kages. Deciden hacer una alianza para enfrentar a Akatsuki. Naruto y Killer Bee se van a una misión de entrenamiento para proteger a los portadores de Bestias con Colas. -
Arco de la Cuarta Guerra Mundial Shinobi
Los cinco Kages se unen para luchar contra Akatsuki. Se reúnen miles de ninjas para crear un ejército. Orochimaru, aliado de Konoha, resucita a los 4 primeros Hokages para ayudar en la guerra. Los Akatsuki, liderados por Tobi, revelado como Obito Uchiha, liberan a las Bestias. La guerra desvela secretos como el pasado de Obito y el propósito de Madara. La batalla culmina en un enfrentamiento entre Obito y Naruto, con la alianza finalmente triunfando en la Cuarta Guerra Ninja. -
Arco de la Guerra Civil de los Uchiha
El clan Uchiha es conocido por su poderoso Sharingan, pero su ambición y descontento los lleva a conspirar contra Konoha. Itachi ejecuta un plan para masacrar al clan, incluyendo a sus padres, a excepción de su hermano. Sasuke, traumatizado, busca vengar a su hermano Itachi después de entrenar con Orochimaru y despierta el Mangekyō Sharingan. Encuentra a Itachi y luchan a muerte, culminando con Sasuke matándolo, aunque dejando un vacío profundo por la pérdida de su hermano. -
Arco de la Batalla Final
Los cinco Kages se reúnen para abordar los problemas del mundo ninja. Obito y Madara siguen causando caos, pero la verdadera amenaza es Kaguya. Naruto, Sasuke y Sakura enfrentan a Kaguya y la derrotan. Luego, en una emotiva batalla, Naruto y Sasuke resuelven sus problemas y empatan, perdiendo ambos sus brazos. El arco concluye con una paz temporal en el mundo ninja, la recuperación de los personajes y un epílogo mostrando a Naruto como Hokage y a su hijo, Boruto.