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1545
Sayri Túpac (1545-1558)
Sayri Tupac, hijo de Manco Inca, asumió el control sobre Vilcabamba trás la muerte de su padre. Sin embargo, se alió con el virrey Andrés Hurtado de Mendoza. En trato consistía en convertirse al cristianismo y aceptar la autoridad del monarca castellano, a cambio recibió dinero, tierras fértiles de Yucay, y un escudo de armas. Pero, terminó siendo envenenado por el jefe cañari, Franscisco Chilche, con quién competía por las tierras. -
1562
Titu Cusi Yupanqui (1562 - 1571)
Tras reiniciar la resistencia en Vilcabamba, enmprendió negociaciones con el gobernador Lope García de Castro, y firmaron la paz de Alcobamba en 1566. En esto constaba el consentimiento y aprobación de TItu Cusi Yupanqui para hacerse vasallo del rey de España, y bautizarse como Diego de Castro. Por parte de los españoles se le entregó el reconocimiento de Inca de jurisdicción sobre Vilcabamba. No obstante, se cree que la causa de su muerte se debe a un envenenamiento por parte de los españoles. -
1571
Túpac Amaru I (1571-1572)
El último Inca de Vilcabamba terminó con las relaciones con el Virrey, ciño la mascaipacha, e impuso al resistencia andina. Por ello, el virrey Franscisco de Toledo envió a un contingente español que tomó Vilcabamba, y apresó al Inca. Este fue después juzgado y ejecutado en la plaza mayor del Cuzco el 24 de Seiembre de 1572.
