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Antonio López de Santa Anna regresó a la presidencia. Realizo el sueño de los centralistas , estableció un imperio tomando el título de Su Alteza Serenísima.
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Juan Álvarez y Florencio Villareal lanzaron el Plan de Ayutla, que estableció la destitución de Santa Anna y la integración de una junta que designara a un presidente provisional que convocara a un Congreso Constituyente
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Juan Álvarez asumió la presidencia de manera interina. Juárez como ministro de justicia y Asuntos eclesiásticos, expidió un decreto que afectó los intereses de la iglesia y el ejército
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Se inauguraron las sesiones del congreso constituyente, conformado principalmente por liberales radicales
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Reconocía las garantías individuales y establecía el juicio de amparo. Reestablecía la república federal, representativa y democrática
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Ignacio Comonfort decidió unirse a la oposición conservadora y fue desconocido como presidente de la república
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Sirvió para que España y Estados unidos ejercieran presión sobre los gobiernos conservador y liberal imponiendo tratados ruinosos
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El resultado de la guerra de reforma fue el triunfo de los liberales sobre los conservadores. Benito Juárez se trasladó a la capital en donde se llevaron a cabo las elecciones y también se reeligió
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Con el apoyo de los conservadores Napoleón III el rey de Francia, se propuso la creación de un imperio Mexicano y a ordenes suyas, en 1862 llegó a Veracruz el conde de Lorencez, general francés con refuerzos para apoyar a las tropas francesas
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En 1863 Puebla fue citada nuevamente, la defensa de la ciudad estuvo a cargo de Jesús González Ortega, Ignacio Comonfort y Porfirio Díaz Mori. En mayo el ejército mexicano se rindió ante las tropas invasoras francesas
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En 1865 se cumplió el término del gobierno de Juárez, quien no consideró conveniente el cambio de poderes debido a la situación conflictiva del país, en el mismo año expidió un decreto por el cual prorrogaba sus funciones presidenciales
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A mediados de 1866, los continos avances del gobierno republicano, la amenaza del retiro de tropas europeas y la critica situación económica determinaron la decisión de Maximiliano de abdicar el trono
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El 15 de mayo de 1867, en la ciudad de Querétaro, Maximiliano, sus generales y algunos soldados fueron hechos prisioneros
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En 1868 Gabino Barreda fundó la escuela nacional preparatoria, institución se educación media que impondría el método positivista, el cual sustituía las explicaciones religiosas por aspectos lógicos y científicos
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En 1871 Benito Juárez se reeligió, compitiendo contra Porfirio Díaz. Las elecciones favorecieron a Juárez y Díaz se pronunció en su contra de la reelección de Juárez con el Plan de la Noria
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Entre 1875 se llevó a cabo la sucesión presidencial, los candidatos a la presidencia fueron Sebastián Lerdo de Tejada, aún presidente, Porfirio Díaz y José María Iglesias
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En 1876 Porfirio Díaz, apoyado por el ejército se opuso a la reelección de Lerdo de Tejada con el Plan de Tuxtepec. Lerdo se reeligió, pero las fuerzas de Díaz lo vencieron
