-
Bahía de Hudson
Entre 1792 i 1812 va treballar a la companyia de la Bahía de Hudson, la mateixa que va cartografiar i el llac superior, el llac més gran d’aigua dolça del món y el tercer en volum, situat entre Canadà i els Estats Units. En aquell primer viatge va navegar el riu Churchill. Un any després es va fracturar la cama i el va obligar a quedar-se un temps en repòs.. Al principi va entrar com aprenent però va acabar fent treballs més importants a la companyia.. -
Companyia del Nord-est
Al 1797 va decidir cambiar de companyia i sense avisar amb un any d’antelació a la companyia de la bahía de Hudson va passar a la companyia del Nord-est. Aquest canvi el va afavorir ja que li donaven treballs més importants. Aquest treball va ser enviar a Thompson a reconèixer una part de la frontera entre Estats Units i Canadà navegant per els rius que arriben fins al llac superior i al llac dels boscos. -
Trobada al llac superior
Al 1804 a la trobada que es celebrava anualment al llac superior, Thompson es va fer soci de l’empresa per comerciar amb pells a la costa de l’oceà pacífic. -
Viatges per la conca del riu Coúmbia
Això el va portar a fer els viatges per la conca del riu Colúmbia al 1806, durant el viatge va cartografiar la zona a més de comerciar pell i de trobar-se amb natius que el deien Koo-Koo-Sint.Va cartografiar 3,9 milions de kilòmetres cuadrats de terres verges al nord del continent americà.