Historia de la bioinformática por Carlos Mario Valencia

  • Inicia la Secuenciación de los Aminoácidos de la insulina

    Inicia la Secuenciación de los Aminoácidos de la insulina
    Frederick Sanger y sus colegas en la Universidad de Cambridge, comienzan la secuenciación de una proteína, la insulina. Al hacerlo, demostró que las proteínas tienen estructuras específicas.
  • Se Establecen Protocolos Para Hacer Cruces de Especies Sexualmente Incompatibles

    Se Establecen Protocolos Para Hacer Cruces de Especies Sexualmente Incompatibles
    Se planean los protocolos para hacer cruces de especies sexualmente incompatibles por medio de hibridización somática (fusión de células totipotentes), rescate de embriones, cultivos celulares y tejidos.
  • Se Presenta la Estructura Molecular en Forma de Doble Hélice del ADN

    Se Presenta la Estructura Molecular en Forma de Doble Hélice del ADN
    El científico estadounidense James Watson y el británico Francis Crick presentan su hallazgo de la estructura molecular en forma de doble hélice del ADN, la molécula portadora del programa genético de los organismos vivos.
  • Identificación de los Fragmentos de la Degradación de la Proteína de la Insulina

    Identificación de los Fragmentos de la Degradación de la Proteína de la Insulina
    Sanger y su equipo, mediante procesos analíticos, separaron e identificaron los fragmentos de la degradación de la proteína de la insulina y determinaron el orden de aparición de los aminoácidos. Secuenciando los 51 aminoácidos de las dos cadenas de insulina, A y B, por métodos ideados por él mismo.
  • Desarrolló de la Vacuna Contra la Poliomielitis.

    Desarrolló de la Vacuna Contra la Poliomielitis.
    La vacuna de la polio llegó de la mano de Jonas Salk, microbiólogo neoyorkino de origen judío y ruso. La historia de su creación es un ejemplo de perseverancia y trabajo duro. En 1947 la Fundación Nacional estadounidense para la Parálisis Infantil, le propuso buscar una manera de frenar la polio, hasta que en 1955 logro su cometido.
  • Se Descubre el Número Total de Cromosomas en el Ser Humano

    Se Descubre el Número Total de Cromosomas en el Ser Humano
    Joe Hin Tjio y Albert Levan, determinaron que la dotación cromosómica (cariotipo) de la especie humana es de 46 cromosomas, es decir 23 parejas. Para ello fue clave la introducción de una serie de mejoras en las técnicas de cultivo de los fibroblastos humanos.
  • Se Describió la Secuencia de la Insulina Bovina

    Se Describió la Secuencia de la Insulina Bovina
    Margaret O. Dayhoff describió la secuencia de la insulina bovina, un pequeño péptido de 51 aminoácidos.
  • Se Descubre la Trisomía del Par 21 Origen del Síndrome de Down

    Se Descubre la Trisomía del Par 21 Origen del Síndrome de Down
    Jérôme Lejeune, Marthe Gautier y R. Turpin, descubren la trisomía 21 propia del síndrome de Down. Principalmente cuando Marthe Gautier quien hizo los cultivos celulares, analizó las metafases, se percató que los pacientes con síndrome de Down tenían 47 cromosomas.
  • Se Determina el Código Genético, Propiciando el Nacimiento de la Bioinformática

    Se Determina el Código Genético, Propiciando el Nacimiento de la Bioinformática
    Se determina el código genético, que son las instrucciones que le dicen a la célula cómo hacer una proteína específica. representadas por los compuestos químicos adenina (A), timina (T), citosina (C) y guanina (G), respectivamente, que constituyen las bases de nucleótidos del ADN. Esto se dio gracias a la química de las proteínas que llevó a los científicos a combinar las estrategias de la biología molecular, las matemáticas y los computadores, naciendo así la bioinformática.
  • Se Obtuvo la Primera Secuencia de un Ácido Nucleico

    Se Obtuvo la Primera Secuencia de un 	Ácido Nucleico
    Se obtuvo la primera secuencia de un ácido nucleico perteneciente a un ARNt que descodifica un codón de alanina en Saccharomyces cerevisiae.
  • Se Crean Algoritmos Para Catalogar y Comparar Secuencias

    Se Crean Algoritmos Para Catalogar y Comparar Secuencias
    la doctora Margaret Oakley Dayhoff, crea algoritmos para catalogar y comparar secuencias. Para esto desarrolló métodos computacionales que le permitieron comparar secuencias proteicas y a partir de los alineamientos entre ellas investigar las relaciones y por tanto la historia evolutiva entre los diferentes reinos, phyla y taxa biológicos, cuyos resultados fueron publicados en su libro titulado “Atlas de secuencia y estructura de proteínas”.
  • Son Descubiertas las Enzimas de Restricción.

    Son Descubiertas las Enzimas de Restricción.
    Hamilton Smith y Daniel Nathans descubren la restrictasa, que es una enzima capaz de reconocer y cortar el ADN en secuencias específicas. Permitiendo el desarrollo de las tecnologías de ADN recombinante. Las enzimas de restricción tienen actividad endonucleasa y cortan enlaces fosfodiéster en las dos cadenas del ADN. Reconociendo ciertas secuencias en el ADN.
  • Primeros Experimentos de Ingeniería Genética

    Primeros Experimentos de Ingeniería Genética
    Stanley Cohen, Paul Berg y Herbert Boyer crearon el primer organismo que recombina partes de su ADN, y que abrió las puertas a la ingeniería genética. Esto se logro por medio de uno de los primeros experimentos de ingeniería genética, demostrando que el gen para el ARN ribosomal de la rana podía ser trasferido y expresado en una célula bacteriana. Construyendo un plásmido, que contenía un lugar de unión para la enzima de restricción EcoRI y un gen de resistencia a la Tetraciclina.
  • Se Puso en Marcha la Base de Datos Protein Data Bank (PDB).

    Se Puso en Marcha la Base de Datos Protein Data Bank (PDB).
    Es una base de datos cuyas estructuras se muestran tridimensionalmente, tanto de proteínas como de ácidos nucleicos. Estos datos, se obtienen mediante cristalografía de rayos X o resonancia magnética nuclear, los cuales son enviados por biólogos y bioquímicos de todo el mundo, para ser subidos a base de datos y poder ser estudiadas por quien necesite de esa información.
  • Primer Gen Clonado, expresado en una Bacteria Foranea.

    Primer Gen Clonado, expresado en una Bacteria Foranea.
    Se crea el primer gen clonado, expresado en un sistema bacteriano. foráneo.
  • Se Crea el Primer Hibridoma

    Se Crea el Primer Hibridoma
    En 1975 Georges Köhler y el investigador argentino César Milstein fusionaron por primera vez linfocitos con células de un mieloma y obtuvieron un hibridoma: , que es la unión de dos células, un linfocito enfermo y un linfocito sano, que crean una línea celular inmortal capaz de producir anticuerpos específicos (monoclonales).
  • Genentech, es la Primera Compañía que Explota la Investigación con ADN

    Genentech, es la Primera Compañía que Explota la Investigación con ADN
    Genentech, se convierte en la primera compañía especializada en biociencias en explotar la investigación con ADN recombinante. Se considera la compañía que fundó la industria de la biotecnología.
  • Se Crea la Primera Matriz PAM (Point Accepted Mutation).

    Se Crea la Primera Matriz PAM (Point Accepted Mutation).
    Margaret Dayhoff crea la primera matriz de substitución de aminoácidos, denominada PAM (Point Accepted Mutation). Que es una de las primeras matrices de sustitución, de mutación puntual aceptada, la cual se calcula observando las diferencias en proteínas cercanamente relacionadas (con un mínimo del 85% de similitud).
  • Se Usan Medios Transgénicos Para Transferir Resistencia al Arroz

    Se Usan Medios Transgénicos Para Transferir Resistencia al Arroz
    la Institución Rockefeller y el Instituto Internacional para la Investigación del Arroz, comienzan el desarrollo de medios transgénicos para transferir resistencia entre la especie Oryza silvestre y más de 60 variedades de arroz. Para ello, se modificaron rasgos importantes en el cultivo, tales como la resistencia a factores bióticos, abióticos y mejoramiento de características agronómicas.
  • Se creó la Primera Base de Datos Computadorizada

    Se creó la Primera Base de Datos Computadorizada
    La doctora Dayhoff creó la primera base de datos computadorizada de la que se tiene noticia, con secuencias de ácidos nucleicos y de proteínas, en un computador casero al que los usuarios externos podían conectarse por vía telefónica.
  • Se Creo la base de datos, GenBank

    Se Creo la base de datos, GenBank
    El grupo de biología teórica y biofísica adscrito al laboratorio nacional de los Álamos, junto con la universidad de Standford, dieron origen a la base de datos, GenBank. Que es el banco de datos de secuencias de ADN, más conocida y grande del mundo.
  • Se Crea el Algoritmo de Alineamiento Local

    Se Crea el Algoritmo de Alineamiento Local
    Temple Smith y Michael Waterman crearon el algoritmo de alineamiento local que permitió optimizar la comparación de secuencias biológicas a lo largo de un alineamiento.
  • Se Crea la base de datos EMBL

    Se Crea la base de datos EMBL
    Se crea la base de datos EMBL (European Molecular Biology Laboratory). la cual se divide en dos categorías básicas: aquellas que describen los componentes moleculares de los sistemas biológicos (esto es, nucleótidos y secuencias de proteínas, estructuras macromoleculares y pequeñas moléculas), y aquellas que describen sus “conductas” o los resultados de dichas conductas (es decir, transcripción, traducción, e interacción).
  • Se Aprueban las Primeras Vacunas de ADN Recombinante

    Se Aprueban las Primeras Vacunas de ADN Recombinante
    Se aprobó la primera vacuna de ADN recombinante para la colibacilosis en Europa y se aprobó también el uso de la insulina recombinante en Estados Unidos e Inglaterra.
  • Se Creo la Base de Datos PSD (Protein Sequence Database)

    Se Creo la Base de Datos PSD (Protein Sequence Database)
    Gracias al internet la base de datos Protein Sequence Database (PSD), se convierte en la más grande del mundo, con más de 2’000,000 de nucleótidos secuenciados, con sus respectivas referencias y anotaciones.
  • Se Crea la Base de Datos DDBJ (DNA Data Bank of Japan).

    Se Crea la Base de Datos DDBJ (DNA Data Bank of Japan).
    El Banco de datos de ADN de Japón ( DDBJ ) es una base de datos biológica que recopila secuencias de ADN. Está ubicado en el Instituto Nacional de Genética (NIG) en la prefectura de Shizuoka de Japón.
  • Se Crea el Algoritmo FASTA

    Se Crea el Algoritmo FASTA
    Se crea el algoritmo FASTA (FAST-All) el cual es un paquete de software para el alineamiento de secuencias de ADN y proteínas inicialmente descrito como FASTP por David J. Lipman y William R. Pearson, lo que hace es una comparación de secuencias, las cuales directamente operaban como motor de búsqueda de secuencias similares dentro de la base de datos GenBank.
  • Se Crea la Técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR).

    Se Crea la Técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR).
    PCR, o la reacción en cadena de la polimerasa, es una reacción química que los biólogos moleculares utilizan para amplificar (crear copias) fragmentos de ADN. Esta reacción permite que unos pocos fragmentos de ADN se repliquen en millones o miles de millones de copias.
  • Se Crean las Bases de Datos SwissProt y PIR

    Se Crean las Bases de Datos SwissProt y PIR
    Se crean las bases de datos para secuencias de proteínas SwissProt y PIR (Protein Information Resource). La SwissProt se caracteriza por que las proteínas que se encuentran almacenadas tienen un alto nivel de anotación. Esto significa que se conoce su estructura tridimensional, la función, las modificaciones post-traduccionales, variantes, etc. mientras que la PIR se caracteriza porque sus bases de datos son consutadas por invetigadores de las lineas de genómica y proteómica
  • Se Implementa el Algoritmo BLAST (Basic Local Alignment Tool)

    Se Implementa el Algoritmo BLAST (Basic Local Alignment Tool)
    Se implementa el algoritmo BLAST (Basic Local Alignment Tool) que mejoro la exploración y búsqueda de secuencias biológicas en bases de datos. Este basicamente es un programa informático de alineamiento de secuencias de tipo local, ya sea de ADN, ARN o de proteínas. El programa es capaz de comparar una secuencia problema (también denominada en la literatura secuencia query) contra una gran cantidad de secuencias que se encuentren en una base de datos.
  • Se Secuencia el Genoma Completo de la Bacteria Haemophilus influenzae.

    Se Secuencia el Genoma Completo de la Bacteria Haemophilus influenzae.
    Primer ser viviente de vida autónoma cuyo patrimonio genético era totalmente develado.
  • Se Secuencia el Genoma Completo del Primer Eucariota Saccharomyces cerevisiae.

    Se Secuencia el Genoma Completo del Primer Eucariota Saccharomyces cerevisiae.
    Se secuencia el genoma completo del primer eucariota Saccharomyces cerevisiae o tambien conocida como levadura. Este organismo unicelular se usa para producir cerveza, biocombustible y medicinas.
  • Se Secuencia el Genoma Completo de la Bacteria Escherichia coli.

    Se Secuencia el Genoma Completo de la Bacteria Escherichia coli.
    La secuencia completa del genoma de la Escherichia coli, tiene 403 genes, con un total de 4.639.221 pares de bases de ADN.
  • Se Secuencia el Genoma Completo del Nematodo Caenorhabditis elegans.

    Se Secuencia el Genoma Completo del Nematodo Caenorhabditis elegans.
    Fue el primer organismo pluricelular en ser secuenciado, con cerca de 20000 genes.
  • Se Aislaron por Primera Vez, Células Madre Embrionarias de Fetos Abortados

    Se Aislaron por Primera Vez, Células Madre Embrionarias de Fetos Abortados
    Gearhart y Thompson aislaron células madre del blastocisto humano, obtenidas de fetos humanos abortados; después las estimularon y obtuvieron diferentes líneas celulares.
  • Se Completa la Secuencia del Primer Cromosoma Humano Completo

    Se Completa la Secuencia del Primer Cromosoma Humano Completo
    El cromosoma 22 es el segundo más pequeño de los cromosomas humanos, compuesto por alrededor de 49 millones de pares de bases, representando entre el 1,5 y 2 % del total de ADN celular. En 1999 se completó su secuencia, siendo el primer cromosoma humano en completarse.
  • Se Secuencian los Genomas Completos de la Mosca de la Fruta y una Planta

    Se Secuencian los Genomas Completos de la Mosca de la Fruta y una Planta
    Se secuencian los genomas completos de la mosca de la fruta (Drosophila melanogaster) y de una planta herbácea (Arabidopsis thaliana).
  • Se Crea la Base de Datos Conocida Como UniProt.

    Se Crea la Base de Datos Conocida Como UniProt.
    PIR-PSD se asoció con EBI (European Bioinformatics Institute) y SIB (Swiss Institute of Bioinformatics), para dar origen a una única base de datos de secuencia y función de proteínas, conocida en la actualidad como UniProt.
  • Aparece el Primer Precursor del Coronavirus Actual, el SARS-CoV

    Aparece el Primer Precursor del Coronavirus Actual, el SARS-CoV
    En las bases de datos se hace referencia a la aparición en China del primer precursor de coronavirus actual, el SARS-CoV (síndrome respiratorio agudo severo) letal para los seres humanos. Este infectó a 8000 personas y mato a 800.
  • Se Completa la Secuencia del Genoma Humano.

    Se Completa la Secuencia del Genoma Humano.
    inicio la era de la revolución genómica, cuya primera etapa culminó con la publicación del genoma humano.
  • Comienza la Era de las Secuenciaciones de Alto Rendimiento

    Comienza la Era de las Secuenciaciones de Alto Rendimiento
    La secuenciación de alto rendimiento, también llamada “de nueva generación” o secuenciación masiva, es un método usado para secuenciar de miles a millones de fragmentos de ADN diferentes al mismo tiempo.
  • Se Completa un Ambicioso Proyecto Denominado HapMap

    Se Completa un Ambicioso Proyecto Denominado HapMap
    Se termina un ambicioso proyecto denominado HapMap (catalogación de variaciones genéticas en el ser humano). El objetivo del Proyecto era crear un mapa de haplotipos del genoma humano, éste describe los patrones comunes de la variación genética humana. proporcionando un recurso clave para encontrar genes que afectan a la salud, la enfermedad y las respuestas a los medicamentos y los factores ambientales.
  • UniProt Presenta un Borrador del Proteoma Completo del ser Humano

    UniProt Presenta un Borrador del Proteoma Completo del ser Humano
    El proteoma humano es un mapa de todas las proteínas que intervienen en el cuerpo humano, vital para conocer más sobre el desarrollo de las enfermedades y otros procesos celulares.
  • La Farmacogenómica se Pone a la Vanguardia, Para Desarrollar Nuevas Vías de Tratamiento

    La Farmacogenómica se Pone a la Vanguardia, Para Desarrollar Nuevas Vías de Tratamiento
    La Farmacogenómica, estudia las bases moleculares y genéticas de las enfermedades, para desarrollar nuevas vías de tratamiento.
  • Aparece el Segundo Precursor del Coronavirus Actual, el MERS-CoV

    Aparece el Segundo Precursor del Coronavirus Actual, el MERS-CoV
    En las bases de datos se registra la aparición del segundo precursor de coronavirus actual, el MERS-CoV (síndrome respiratorio de Oriente Medio), cuyo índice de letalidad era del 30%, infectando y matando a 2400 personas.
  • Se Crea la HTS

    Se Crea la HTS
    La HTS, es una tecnología de secuenciación avanzada novedosa y rápida que se usa comúnmente en transcriptómica, genómica y
    epigenómica. Esta que junto con técnicas de computación paralela de alta potencia permiten en tiempos muy cortos y a costos bastante competitivos secuenciar genes y genomas implicados en diversas enfermedades.
  • Se Hace Uso Masivo del Big Data

    Se Hace Uso Masivo del Big Data
    Con Big Data se efectúan análisis retrospectivos de moléculas y de compuestos para reposicionarlos o encontrarles nuevos usos o simular la unión entre antígenos y anticuerpos, mediante inteligencia artificial.
  • Llega el SARS-CoV-2, Precionando la Bioinformática al Maximo

    Llega el SARS-CoV-2, Precionando la Bioinformática al Maximo
    Llega el SARS-CoV-2, que es el coronavirus actual, que es de origen animal y muto a los seres humanos de una forma altamente infecciosa. En tiempo record los cientificos de todo el mundo y todas las disciplinas se integraron para entender el virus.
  • El SARS-CoV-2, las Pruebas PCR y la interación con la Bioinformática

    El SARS-CoV-2, las Pruebas PCR y la interación con la Bioinformática
    Por medio de pruebas PCR con muestras obtenidas de exudado nasofaríngeo, exudado nasal, aspirado traqueobronquial y esputo, se obtienen resultados de positividad de 5 a 7 días y gracias a la información suministrada por las bases de datos a nivel mundial, se comienzan a catalogar y categorizar las diferentes mutaciones del virus desde la variante alfa originada en Wuhan-China, hasta la delta en la actualidad.
  • El SARS-CoV-2, la Vacuna y la interación con la Bioinformática

    El SARS-CoV-2, la Vacuna y la interación con la Bioinformática
    Según un estudio de la Universidad de Oxford, solo tomo 10 meses para que Pfizer/BioNTech, entre otras casas farmacéuticas desarrollar una vacuna contra el SARS-CoV-2, gracias a los avances tecnológicos del último siglo y a la eficiente gestión de la bioinformática en el manejo de bases de datos.