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No es posible afirmar quién inventó el microscopio, sin embargo, se señala a Zacharias o a Hans como legítimos inventores del microscopio.
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Presentó su diseño de microscopio óptico combinando una lente cóncava junto con una convexa.
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Fabricó su diseño con dos lentes, sin embargo él utilizó dos lentes convexas.
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Giovanni fue la primer persona en referirse a éste invento como "microscopio".
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Robert Hooke publicó "Micrographia" en el cual describía sus observaciones hechas mediante un microscopio de la época; a través de éste, observó insectos, plantas y otras cosas. En este libro Hooke hace su aporte más importante: la palabra "célula".
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Encontró la combinación de lentes para reducir significativamente la aberración cromática.
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El británico Jeremiah construyó el primer revólver para microscopio que permitía cambiar el objetivo mediante el cual se observaba la muestra.
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Perfeccionó la idea de corregir la aberración esférica que planteó Chester Moore Hall, y demostró que tal aberración podía ser corregida variando la distancia entre lentes.
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El físico investigador Ernest sentó las bases para la teoría de la óptica actual, lo cual permitió mejorar la calidad de los objetivos de inmersión.
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La empresa Carl Zeiss empezó a comercializar el primer microscopio de rayos ultravioleta, el cual doblaba la resolución de los microscopios ópticos.
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Una de las innovaciones de la empresa Leica fue el microscopio binocular.
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Construyeron juntos el primer microscopio electrónico, que superaba en resolución al microscopio óptico.
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El interés por el microscopio de rayos x empezó después de la segunda guerra mundial, y en 1951 Ellis y William construyeron un microscopio de este tipo, el cual ofrecía una mejor resolución que el microscopio óptico.
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En este periodo de tiempo se dieron muchísimos más aportes para seguir desarrollando el microscopio, principalmente en la forma de iluminar la muestra, lo cual ha dado lugar al microscopio de contraste de fases, al microscopio de contraste por interferencia diferencial y al microscopio de fluorescencia, tal y como los conocemos en la actualidad.