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difusión de las nuevas técnicas para secuenciar el ADN y las proteínas
así como el volumen cada vez mayor de secuencias almacenadas en los bancos de datos, hicieron necesaria la creación de algoritmos a fin de catalogar y comparar secuencias, en los que se reconoce como pionera a Margaret Oakley Dayhoff, connotada investigadora del Centro Médico de la Universidad de Georgetown. -
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secuenció en forma completa una proteína, la insulina
La bioinformática es pues una ciencia de naturaleza interdisciplinaria, cuya historia se partió en dos después que por vez primera se secuenció en forma completa una proteína, la insulina, por parte de Frederick Sanger y sus colegas en la Universidad de Cambridge. -
Watson y Crick "modelo de la doble hélice"
explicaron la estructura del ADN -
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aparición herramientas computacionales
hicieron posible el análisis y la resolución de interrogantes que ya estaban planteados en la propia estructura del ADN, en la información genética codificante de las proteínas, en las propiedades estructurales de estas y en los factores que la regulan. -
Premio Nobel de química
Gracias al hallazgo de que cada proteína posee una estructura primaria única, Sanger obtuvo el Premio Nobel de química -
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Desarrollo de otros metodos de secuenciación
Con posterioridad se desarrollaron otros métodos de secuenciación menos dispendiosos y más eficientes que el de Sanger, como la
reacción de degradación de Edman, las columnas de intercambio iónico y la electroforesis, que contribuyeron a la automatización de la secuenciación y al desarrollo de librerías de aminoácidos. -
creciente cantidad de datos
referentes a la química de las proteínas llevó a los científicos a combinar las estrategias de la biología molecular, las matemáticas y los computadores, para enfrentar con éxito el desafío que ello representaba -
desarrolló métodos computacionales
La doctora Dayhoff desarrolló métodos computacionales que le
permitieron comparar secuencias proteicas y a partir de los alineamientos entre ellas investigar las relaciones y por tanto la historia evolutiva entre los diferentes reinos, phyla y taxa biológicos. -
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Computadores al alcance de los investigadores
la nueva ciencia no hubiera sido posible sin el concurso de los computadores digitales de alta velocidad. Inventados en el marco de programas de investigación para diseñar armamento bélico durante la segunda guerra mundial, los computadores sólo estuvieron al alcance de los investigadores a comienzos de la década de 1970 aunque con una disponibilidad muy limitada, 15% del total de centros de investigación y universidades de los Estados Unidos de América. -
Creación de la primera base de datos computacionales
la doctora Dayhoff creó la primera base de datos computadorizada de la que se tiene noticia, con secuencias de ácidos nucleicos y de proteínas, en un computador casero al que los usuarios externos podían conectarse por vía telefónica -
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trabajo de Margaret Oakley Dayhoff impulsó la generación de bases de datos primarias como GenBank, FASTA y BLAST
A finales de la década de 1980 y comienzos de la de 1990, el trabajo de Margaret Oakley Dayhoff impulsó la generación de bases de datos primarias como GenBank, FASTA y BLAST (Basic Local Alignment Tool). Mientras GenBank almacenaba y catalogaba las
secuencias de ADN y de proteínas, BLAST permitía comparar con mayor rapidez que su predecesor FASTA las secuencias de interés contra cada una de las secuencias contenidas dentro de la enorme base de datos. -
base de datos Protein Sequence Database (PSD)
era la base de datos más grande del mundo, con más de 2’000,000 de nucleótidos secuenciados, con sus respectivas referencias y anotaciones. Sin embargo, este avance no hubiera sido posible sin la llegada de Internet. -
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Caracterización de la bioinformática
Estuvo pues la bioinformática caracterizada en la década de 1990 por la utilización de bases de datos primarias que contenían información experimental en gran escala en las áreas de genómica y proteómica, lo que permitió comprender las funciones de los genes y de las proteínas. -
Definición de la bioinformática
Brown define la bioinformatica "«el uso de computadores para la adquisición, manejo y análisis de la información biológica" en la intersección de la biología molecular, la biología computacional, la medicina clínica, las bases de datos informáticas, el Internet
y el análisis de secuencia -
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existencia de dos eras consecutivas en la historia de la bioinformática
pre-secuenciación y era post-secuenciación -
PIR-PSD se asoció con EBI (European Bioinformatics Institute) y SIB (Swiss Institute of Bioinformatics)
Esta asociación daría origen a la una única base de datos de secuencia y función de proteínas, conocida en la actualidad como UniProt -
bases secundarias
En la actualidad, existen bases secundarias, llamadas también bases de conocimiento porque contienen el conocimiento biológico acumulado necesario para comprender el funcionamiento y la utilidad en todos los niveles de organización de un ser vivo (molecular, celular, organismo). Así por ejemplo, estas bases incluyen todas las familias de proteínas con sus dominios
funcionales y sus estructuras tridimensionales, así como
también las diferentes vías de señalización -
Creación en linea (online) Protein Identification Resource (PIR)
cualquiera podía identificar proteínas a partir de los datos de composición de aminoácidos o de secuencias, como también efectuar predicciones con base en éstas, o sencillamente buscar información.