Bioinformatica1

La Bioinformática a través de la historia

  • Period: to

    Aparición de aminoácidos

    Sanger y su equipo, mediante un laborioso proceso analítico, separaron e identificaron los fragmentos de la degradación de la proteína y determinaron el orden de aparición de los aminoácidos, algo que nadie hasta ese momento había sido capaz de hacer.
  • Descubrimiento de la doble hélice de ADN

    Descubrimiento de la doble hélice de ADN
    Watson y Crick con las investigaciones previas de Rosalin Franklin realizan el descubrimiento de la doble hélice de ADN
  • Sanger premio Nobel de Quimica

    Sanger premio Nobel de Quimica
    Sanger, obtiene el premio nobel de química debido al descubrimiento de la existencia de la estructura primaria de cada proteína, con el cual define el rumbo de la bioinformática, pues se hizo evidente la necesidad de interpretar la información contenida en las secuencias de ADN, ARN y proteínas.
  • Aparece la bioinformática

    Aparece la bioinformática y la biología computacional en respuesta a la alta cantidad de datos de proteínas en la química.
  • Invención de la computadora

    Inventados en el marco de programas de investigación para diseñar armamento bélico durante la segunda guerra mundial, los computadores sólo estaban al alcance de los investigadores a principios de la década de 1970, aunque con una disponibilidad muy limitada, 15% del total de centros de investigación y universidades de los Estados Unidos de América.
  • Needleman y Wunsch

    Desarrollaron los modelos de alineamiento global para pares de cadenas.
  • Sankoff

    Desarrollo de las restricciones por inserciones o deleciones.
  • Dayhoff

    Uso de matrices de mutación.
  • La primera base de datos

    La primera base de datos
    Margaret Oakley Dayhoff creo la primera base de datos computarizada de la que se tiene noticia de ácidos nucleicos y proteínas en un computador casero al que usuarios externos se conectaban vía telefónica.
  • Period: to

    Comienzo de la Bioinformática

    Se construyo la teoría para la comparación de secuencias de proteínas basados en trabajos de construcción de las matrices de sustitución y matrices PAM lideradas por Dayhoff, posteriormente adaptada para el estudio de secuencias de ADN y conceptualmente modificado para el análisis de cadenas mas largas.
  • La Protein Sequence Database

    La Protein Secuence Database, era la base de datos mas grande del mundo con mas de 2.000.000 de nucleótidos secuenciales con sus respectivas referencias y anotaciones.
  • Period: to

    Diseño de algoritmos

    Diseño de la familia de algoritmos que basan su búsqueda en bases de datos como FASTA por Wilbur y Lipman; Lipman y Pearson.
  • PCR

    Crecimiento de datos debido a la Técnica de la Reacción en Cadena de la Polimerasa - PCR
  • Feng y Doolitte

    Diseñaron algoritmos que permiten el análisis comparativo múltiple de mas de dos cadenas
  • Period: to

    Centro HUGO

    Se fundo el The Human Genoma Organisation y el Instituto Nacional de Salud de los Estados Unidos.
  • Transformación del HUGO

    HUGO se transforma en el Instituto Nacional de Investigaciones del Genoma Humano NHGRI (National Human Genome Reserch Institute)
  • Primeros genomas

    Se publicaron los primeros genomas bacterianos para las especies Haemophilus inflienzae y Mycoplasma genitalisum
  • Bown

    Definió la bioinformática como «el uso de computadores para la adquisición, manejo y análisis de la información biológica», de modo que la contextualiza «en la intersección de la biología molecular, la biología computacional, la medicina clínica, las bases de datos informáticos, el Internet y el análisis de secuencia
  • Se creo el DDBJ

    El banco de datos de Japón da inicio a la constricción de redes de comunidades de la bioinformática que permitirán canalizar y difundir los desarrollados en el campo para permitir una comunicación a nivel mundial entre los investigadores como BIONET
  • Uniprot

    PIR - PSD se asocia con EBI - European Bioinformatics Institutes y SIB - Swiss Institute of Bioinformatics para dar origen a una única base de datos de secuencia y función de proteínas, conocida en la actualidad como Uniprot.
  • Ouzounis y Valencia

    Indican que la creación de las dos primeras fuentes para almacenamiento de datos de secuencia de genes y proteínas se realizo antes de los 90, GeneBank y el EMBL Data Library
  • La primera técnica de segunda generación

    Dentro de las primeras tecnologías, la primera técnica de segunda generación introducida en el mercado en 2005 se conoció como 454 cuyo tamaño de lecturas era cercano a 600 pares de bases (actualmente esta tecnología se encuentra fuera de uso comercial).
  • Illumina

    Se lanzó al mercado Illumina con productos de tamaño de lecturas hoy en día cercano a los 100 pares de bases y cuya metodología fue utilizada para el resecuenciamiento del genoma humano.
  • Genoma humano

    Se logra la secuencia completa del genoma humano y se da inicio al mapeo del proteoma.
  • SOLiD

    SOLiD de Life Technologies: Applied Biosystems ha sido
    también utilizado dentro de este marco de secuenciadores
    de segunda generación y por primera vez usado en el estudio
    del posicionamiento de nucleosomas
  • Métodos de tercera generación

    Se basan en el secuenciamiento directo de
    ADN o conocido como secuenciamiento en tiempo real de
    cadena única (en inglés single-molecule real-time (SMRT)
    sequencing).