Historia de la Bioinformatica

  • Teoría de la evolución molecular

    Linus Pauling
    Noción Reloj molecular que es una técnica que permite datar cuando divergieron dos especies basándose en el número de diferencias entre secuencias concretas de sus moléculas de DNA, RNA o proteínas.
  • Primer Atlas de secuencia y estructura de proteínas

    Margaret Dayhoff
    Base para el desarrollo estadístico de las matrices de sustitución PAM y precursor de las actuales bases de datos de proteínas
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    ARPA

    Agencia de Proyectos de Investigación Avanzados (ARPA) en el área de la tecnología que permite generar los protocolos de conmutación de paquetes de datos sobre redes de ordenadores
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    ARPANET

    Enlace entre redes de computación que luego se convertiría en Internet
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    Algortimo Needleman-Wunsch

    Publicación del Algoritmo Needleman-Wunsch para alineamiento de secuencias
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    Brookhaven Protein Data Bank

    Primera base de datos de la estructura tridimensional de las proteínas y ácidos nucleicos
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    Paul Berg

    Creación de la primera molécula de ADN recombinante
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    Edwin Southern

    Desarrollo de técnica Southern blot de localización de secuencias específicas de ADN. Esta técnica es utilizada para detectar una secuencia específica de ADN en una muestra de sangre o tejido
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    F. Sanger y R. Staden,

    Secuenciación de ADN y desarrollo de software para analizarlo
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    1°Publicacion de secuencia de genes

    Se publica e la primera secuencia de genes completa de un organismo desarrollado por F. Sanger y R. Staden fagoΦ-X174.
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    Secuenciación del genoma del fago λ

    Secuenciación del genoma del fago λ (fago lambda) utilizando una nueva técnica, y se convierte en la la secuenciación shotgun (secuenciación por perdigonada) desarrollado por F. Sanger
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    K. Wüthrich

    Publica el método de utilización de la RMN (Resonancia magnética nuclear) para determinar estructuras de proteínas.
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    Secuencia motivo

    Ford Doolittle
    Concepto enfocado en las similitudes supervivientes
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    algoritmo Smith-Waterman

    Estrategia para realizar alineamiento local de secuencias biológicas (ADN, ARN o proteínas), es decir determinar regiones similares entre un par de secuencias
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    GenBank

    Aparición de banco de datos biológicas
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    PCR

    D. T. Burke et al,
    Descubrimiento de la PCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa) que lleva a la multiplicación de muestras de ADN, lo que permitirá su análisis único.
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    Algoritmo Wilbur-Lipman

    Desarrollo del algoritmo de búsqueda en bases de datos de secuencias Wilbur-Lipman,
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    CD

    Aparición del estándar Compact Disc (CD)
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    dominio DNS

    Jon Postel y Paul Mockapetris desarrollan el sistema de nombres de dominio DNS necesario para un direccionamiento correcto y ágil en Internet
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    FASP/FASTN

    Búsqueda rápida de similitudes entre secuencias.
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    Swiss-Prot

    Aparición de bases de datos biologicas
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    YAC y chips de ADN

    El investigador D. T. Burke, describe el uso de cromosomas artificiales de levadura (YAC, Yeast Artificial Chromosome), y Kulesh et al. sientan las bases de los chips de ADN, gracias al desarrollo de la PCR
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    Human Genome Project

    Aporte de fondos a proyectos genoma por parte de la NIH (National Institutes of Health y arranque de la Human Genome Initiative, más conocida finalmente como (Proyecto Genoma Humano).
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    Lenguaje de programación PERL y actividades privadas del genoma

    Larry Wall desarrolla el lenguaje de programación PERL, de amplio uso en bioinformática. En este periodo tambien se reflejan las primeras compañías privadas importantes con actividades vinculadas al genoma, proteínas, bioquímica como Genetics Computer Group – GCG, Oxford Molecular Group, Ltd.
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    FASTA

    Pearson y Lipman
    Desarrollo del algoritmo FASTA para comparación de secuencias ()
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    EMBnet

    Redes de interconexión entre bases de daros
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    Metodo Márkov

    Utilización del método Márkov para analizar patrones y composición de las secuencias para luego localizar genes y predecir estructuras proteicas
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    BLAST y PRINTS

    1990: Búsqueda rápida de similitudes entre secuencias con BLAST
    1994: Base de datos de huellas de proteínas PRINTSde Attwood y Beck.
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    EST y mapa de ligamiento genético

    1991: Inicio de la secuenciación con EST (Marcaje de Secuencias Expresadas)
    1992: publicación del mapa de ligamiento genético (en baja resolución) del genoma humano completo
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    ClustalW Y PSI-BLAST

    Orientado al alineamiento múltiple de secuencias
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    Secuenciacion de bacterias

    Secuenciación completa de los primeros genomas de bacterias (Haemophilus influenzae, Mycoplasma genitalium, de 1,8 millones de pares de bases -Mbps- y 0,58 Mbps, respectivamente)
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    Secuenciación Eucariota

    Secuenciación por cromosoma) del genoma eucariota, el de la levadura (Saccharomyces cerevisiae, con 12 Mbps) en 1996 y en 1997 con el genoma de Escherichia coli (4,7 Mbps)
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    Secuenciación de organismo multicelular

    1998: Secuenciación del primer genoma de un organismo multicelular (97 Mbp del Caenorhabditis elegans),
    1999: Secuenciación del primer cromosoma humano (el 22) completamente secuenciado (33,4 Mbps).
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    Culminación proyectos secuenciación genómica

    2000: Publicación de genoma de Arabidopsis thaliana (100 Mb) y el de Drosophila melanogaster (180 Mbp).
    2001: Publicación del genoma humano (3 Gbp).
    2003: Se completa el Human Genome Project.
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    Instituto Nacional de Bioinformática

    En España se funda el Instituto Nacional de Bioinformática, soportado por la Fundación Genoma España (fundada para potenciar la investigación en este campo)
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    Genoma de Rata

    Estudio del genoma de Rattus norvegicus (rata)
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    Chip ADN

    En 2004, la FDA autoriza el uso de un chip de ADN por primera vez.
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    Genoma chimpance

    Estudio e investigación del genoma del chimpancé
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    Proyecto HapMap

    Se completa el proyecto HapMap (catalogación de variaciones genéticas en el ser humano)
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    Genoma del macaco rhesus

    Estudio del genoma del macaco rhesus
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    Genoma gato domestico

    Estudio del genoma del gato domestico
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    Genoma de la mujer

    Se secuencia por primera vez el genoma de una mujer gracias al desarrollo de las técnicas adecuadas.
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    Proteoma del ser humano

    UniProt presenta el primer borrador del proteoma completo del ser humano, con más de veinte mil entradas.
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    Hleicos Genetic Analyser System

    Primera plataforma de implementación NGS (Next Generation Sequencing) que utilizo la secuenciación fluorescente en una molécula para identificar la secuencia exacta de un fragmento de ADN.
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    SMRT

    La Secuenciación SMRT o secuenciación a tiempo real de una única molécula de ADN es una tecnología de secuenciación por síntesis de una molécula de ADN fija desarrollada por Pacific Bioscience
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    Nanoporo

    La tecnología de nanoporos propuesta en 1996 por David Deamer y Daniel Branton y desarrollada por la empresa Oxford Nanopore Technologies ONT a nivel comercial p
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    Single cell RNA-seq

    La combinación de tres tecnologías permiten conocer "la vida íntima" de las células y poder ver el desarrollo embrionario con máximo detalle.
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    Nuevas proteinas desarrolladas

    El bioquímico David Baker desarrollo una tecnología que permite diseñar proteínas que nunca antes se han visto en la naturaleza.
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    ADN Fetal

    La Dr. Yuk Ming Dennis Lo, descubre ADN del feto presente en la sangre materna y que la sangre fetal puede usarse para comprobar posibles trastornos genéticos en el feto.