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Frederick Sanger y sus colegas en la Universidad de Cambridge
La historia se partió en dos después que por vez primera se secuenció en forma completa una proteína, la insulina. Mediante un laborioso proceso analítico, separaron e identificaron los fragmentos de la degradación de la proteína y determinaron el orden de
aparición de los aminoácidos. -
Uso de las herramientas computacionales
La creciente cantidad de datos referentes a la química de las proteínas llevó a los científicos a combinar las estrategias de la biología molecular, las matemáticas y los computadores, para enfrentar con éxito el desafío que ello representaba. Y en este
punto aparecen la bioinformática y la biología computacional como disciplinas íntimamente relacionadas. -
Watson y Crick y el modelo de la doble hélice
Proyecto creado para explicar la estructura del
ADN, que daría origen a problemas
algorítmicos susceptibles de un manejo altamente cuidadoso y organizado que necesitaría de herramientas computacionales para su almacenamiento, secuenciación y análisis. -
Margaret Dayhoff creó la primera base de datos de secuencias biológicas
Con la constante producción de información biológica, la cual crecía a un ritmo lento comparado con el actual volumen de generación de datos, se creó la necesidad de recopilar y organizar toda la información generada a partir de dichos proyectos de secuenciación, en la cual almacenó y puso a disposición de la comunidad científica todas las secuencias de ADN y proteínas descritas hasta la fecha. -
Needleman y Wunsch -Alineamientos globales de dos secuencias
Se suele utilizar en el ámbito de la bioinformática para alinear secuencias de proteínas o de ácidos nucleicos. Se trata de un ejemplo típico de programación dinámica. El algoritmo funciona del mismo modo independientemente de la complejidad o longitud de las secuencias y garantiza la obtención del mejor alineamiento. -
Protein Data Bank (PDB)
se anunció y creó la base de datos más antigua que se conoce
y la cual sigue vigente. Esta base de datos surgió inicialmente con el
propósito de almacenar las estructuras proteicas
determinadas por cristalografía de rayos X.
También lo hace como reservorio de estructuras de toda clase de macromoléculas conocidas: ADN, ARN (ARNm, ARNr y ARNt) y
grandes complejos proteicos asociados con todo tipo de biomoléculas. -
Margaret Dayhoff y la primera matriz de substitución de aminoácidos- PAM (Point Accepted Mutation)
Se genera la primera matriz de substitución de aminoácidos, Tal avance en la interpretación de patrones de secuencia, obtenidos
a partir de información biológica, abrió el camino a los estudios sobre evolución molecular que actualmente aportan una visión más aproximada a las verdaderas relaciones filogenéticas entre especies. -
Theoretical Biology and Byophysics Group adscrito al instituto norteamericano The Alamos Nacional Laboratory, junto con Standford University y su base de datos GenBank
Base de datos más conocida en el mundo, es la base de datos de secuencias genéticas del NIH (National Institutes of Health de Estados Unidos), una colección de disponibilidad pública de secuencias de ADN, es parte de International Nucleotide Sequence Database Collaboration, que está integrada por la base de datos de ADN de Japón (DNA DataBank of Japan (DDBJ)), El Laboratorio Europeo de Biología Molecular (European Molecular Biology Laboratory (EMBL)). -
Temple Smith y Michael Waterman y la creación de algoritmo de alineamiento local.
Revisaron los algoritmos matemáticos propuestos por Needleman y Wunsch en 1970 para la comparación de secuencias biológicas. Como resultado de sus análisis, generaron el conocido algoritmo de alineamiento local que permitió optimizar la comparación de secuencias biológicas a lo largo de un alineamiento.
Este método de análisis se convirtió en la contribución más importante para la comparación directa de secuencias y en la piedra angular del alineamiento por pares de secuencias -
Period: to
Inicio de la era de las grandes bases de datos en el mundo
Pocos años después de la creación del GenBank, se generaron sus versiones europea y asiática, conocidas como la base de datos
EMBL (European Molecular Biology Laboratory) y DDBJ (DNA Data Bank of Japan) -
Algoritmo FASTA (FAST-All) de comparación de secuencias.
El cual directamente operaba como motor de búsqueda de secuencias similares dentro de la base de datos GenBank. -
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Bases de datos SwissProt y PIR (Protein Information Resource)
Bases de datos para secuencias de proteínas. -
Stephen Altschul y colaboradores (Algoritmo BLAST (Basic Local Alignment Tool)
Se originó otro de los hitos más importantes de la bioinformática.
La implementación de este algoritmo revolucionó completamente
la exploración y búsqueda de secuencias biológicas
en bases de datos. El estudio publicado, se considera como el método computacional de mayor uso y la referencia literaria de mayor citación en la historia de la ciencia. -
Proyecto de secuenciación del genoma humano (Human Genome, HUGO)
Con la creación del consorcio para la ejecución
del proyecto de secuenciación del genoma
humano , se inició la era genómica. Siendo la decodificación
del genoma humano un proyecto tan ambicioso,
otros consorcios se hicieron con el logro de secuenciar los primeros genomas no virales. -
Period: to
Los genomas de Haemophilus influenzae y Escherichia coli
Fueron los primeros genomas bacterianos publicados. -
S. cerevisiae
Fue el primer genoma eucariota secuenciado. -
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Caenorhabditis elegans, Pseudomonas aeruginosa, Drosophila melanogaster y Arabidopsis thaliana.
Se entregaron los genomas secuenciados. -
Finalizó la secuencia definitiva del genoma humano.
Un hito para la historia de la Humanidad.
El método utilizado por el PGH para producir la versión final del código genético humano se basa en un mapa, o una secuencia basada en BAC. El ADN humano es fragmentado en piezas de un tamaño manejable (entre 150.000 y 200.000 pares de bases). Los fragmentos son clonados en bacterias, las cuales almacenan y replican el ADN humano para que pueda ser preparado en cantidades lo suficientemente grandes para secuenciarlo. -
Period: to
BIOTECNOLOGÍA EN COLOMBIA, Ley 1289 de 2009, Ley de Ciencia, Tecnología e Innovación.
Un estudio publicado por Colciencias, la Universidad Nacional de Colombia y CORPOGEN. Dicho estudio hace referencia al desarrollo de la biotecnología en Colombia y el nuevo esquema del Plan Nacional de Biotecnología que proyecta la investigación en bioinformática en Colombia. Cabe destacar los esfuerzos que desde hace varios años CENICAFE y su proyecto Genoma del Café, el cual tiene como objeto principal un extenso análisis de genómica funcional y estructural del café colombiano.
