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Historia de la bioinformática

  • Period: to

    Primera secuenciación completa

    Frederick Sanger y sus colegas de la Universidad de Cambridge logran secuenciar de forma completa una proteína: la insulina.
  • Period: to

    Inicio de la carrera de la secuenciación

    A inicio de la década de los 50 se inicia la carrera por la secuenciación de pequeñas moléculas biológicas.
  • Doble hélice de ADN

    Watson y Crick proponen la doble hélice para explicar la estructura del ADN
  • Period: to

    COMPROTEIN Software

    Margaret Dayhoff junto a Robert S. Ledley combinaron su experiencia y desarrollaron COMPROTEIN, programa informático completo para el IBM 7090 diseñado para determinar la estructura primaria de proteínas utilizando datos de secuenciación de péptidos.
  • Inicio de la aplicación computacional

    Aparece la bioinformática y la biología computacional en la biología molecular
  • Primera secuenciación de un ácido nucleico

    Pertenecía a un ARNt que descodificaba un codón de alanina en Saccharomyces cerevisiae.
  • Atlas de secuencia y estructura de proteínas

    Margaret Oakley Dayhoff desarrolla métodos computacionales para comparar secuencias proteicas, y a partir de alineamientos investiga relaciones y la historia evolutiva entre los reinos. Su libro publicado "Atlas" contenía 65 secuencias de proteínas.
  • Primer algoritmo de alineamiento

    Needleman y Wunsh desarrollan modelos dinámicos para alineamientos de secuencias de proteínas por pares de cadenas.
  • Protein Data Bank - PDB

    Protein Data Bank es la base de datos mas antigua que se conoce y que aun es vigente, surgió con el propósito de almacenar estructuras proteicas determinadas por cristalografía de rayos X.
  • Primera base de datos

    Margaret Dayhoff crea la primera base de datos computarizada con secuencia de ácidos nucleicos y de proteínas en un computador casero.
  • Primer algoritmo de alineación de secuencias múltiples (MSA)

    El primer algoritmo de MSA publicado de Needleman-Wunsh implico el uso de una matriz de puntuación, su dimensión es igual al número de secuencias.
  • Period: to

    Generación de base de datos primarios

    A finales de los años 80 se impulsa la generación de bases de datos primarios como GenBank, FASTA y BLAST.
  • Algoritmos de busqueda

    Se diseño el algoritmo que basa su busqueda en bases de datos como FASTA.
  • Protein Sequence Database - PSD

    La Protein Sequence Database - PSD, era la base de datos más grande del mundo, con mas de 2 millones de nucleótidos secuenciados.
  • Software GCG

    El Grupo de Computación Genetica de la Universidad de Wisconsin publico el paquete de software homonimo "GCG", era una colección de 33 herramientas de línea de comandos para manipular secuencias de ADN, ARN o proteínas.
  • Optimización de comparación de secuencias

    Temple Smith y Michael Waterman revisan los modelos y algoritmos de Needleman y Wunsh, como resultado generan el algoritmo de alineamiento local que permitió optimizar la comparación de secuencias biológicas a lo largo de un alineamiento.
  • MSA CLUSTAL

    La verdadera alineación de secuencias múltiples (MSA) fue desarrolla por Da-Fei Feng y Russell Doolitle hasta 1987, su secuencia progresiva era una alineación de Needleman-Wunsch, extraer puntajes de similitud, usar los puntos y construir un árbol guía y luego alinear las dos secuencias similares; esto genero un año despues el desarrollo de MSA CLUSTAL como simplificación del algoritmo Feng-Doolitle que hoy en día se usa.
  • Algoritmos para el análisis

    Se da inicio al diseño e implementación de algoritmos para el análisis comparativo de secuencias de proteínas y de genes o para la búsqueda de patrones o repeticiones.
  • Human Genome - HUGO

    Se crea el consorcio para el proyecto de la secuenciación del genoma humano (Human Genome - HUGO). Se da el inicio a la era genímica.
  • Primero genomas bacterianos

    Se publican los primeros genomas bacterianos para las especies Haemophilus influenzae y Mycoplasma genitalium
  • Genoma humano

    Se publica el primer borrador del genoma humano y el primer mapa físico del genoma humano por The International Human Genome Sequencing Consortium.
  • Una defición de bioinformática

    Brown define la bioinformática como el uso de computadores para la adquisición, manejo y análisis de la información biológica
  • Pirosecuenciador 454 GS20

    La pirosecuenciación fue desarrollada en los años 90 pero fue hasta el 2005 que apareció el primer equipo que usaba pirosecuenciación de forma masiva. Fue la primera tecnología de la segunda generación disponible, sin embargo para 2016 esta tecnología fue abandonada.
  • Genome Analyzer

    Primer secuenciador de Solexa (fundado en 1998), tiene la capacidad de secuenciar 1 gigabase (Gb) de datos en una sola ejecución.
  • Helicos Genetic Analyser System

    Primera plataforma de implementación NGS (Next Generation Sequencing) que utilizo la secuenciación fluorescente en una molécula, este método permite identificar la secuencia exacta de un fragmento de ADN.
  • Secuenciación a tiempo real de una sola molécula SMRT

    Pacific Biosciences (PacBio), lanza al mercado su primer secuenciador, el cual usa células de flujo que se basan en la tecnología guía de onda de modo cero, que es un dispositivo que focaliza toda la luz hacia un punto para su detección; esto permite registrar la señal lumínica emitida por un fluoróforo unido a un único nucleótido.
  • MinION

    La empresa Oxford Nanopore Technologies desarrolla un secuenciador de tamaño bolsillo, la secuenciación se da por nanoporos, el cual analiza el ADN de forma directa al empujarlo a través de un poro suspendido.